博士能跟本科生一起吗？
可以，我们课题组就有这种情况，不过我不是很懂这种安排的意义何在…… 首先，题主没有介绍你们学校以及专业的情况，所以我不知道你们学校是否允许这样操作——我们学校是不能的（哪怕你是导师的直博）；其次，我也不明白这个安排的利弊到底在哪儿。一般不是特别缺学生的教授是不会这么做的。 以我个人为例，我的导师是某985学校的博导，他在申请项目的时候是没有填写我的名字的（也就是说他只申请了两个人，而我跟他已经联系了很久了），而在过程中他也没有直接联系我，而是通过其他老师间接让我发邮件跟他交流。
到了中期答辩和开题答辩的时候我才被他叫去现场给他做PPT演示……当然，我毕竟是直博，这种情况下我理解他的顾虑，但是如果是硕博连读或者本科保送的人跟我处在同一实验室，那我真是不能苟同这种做法了。因为从你的描述里看不清楚你研究生阶段的学术成果（如果有的话肯定是对你有好处的），反而可以看到你的实验数据等（如果单纯从字面理解的话），那么请问这些数据分析都是谁做的呢？是不是说明其实你对这个方向并没有很深的研究？那为什么要读博？
当然，你说你可能会觉得在读研期间对某个研究方向感兴趣所以想继续深造，那为什么不在保研的时候选择这个研究方向的老师而不是在现在这个阶段再重新选择？ 可能我说的有些刻薄，但希望你深思熟虑后慎重决定。